清華大學在2012年開始招收工程管理碩士，并在2015年5月成立了工程管理碩士（MEM）教育中心。中心在研究生院指導下，依托十四個院系（工業工程系、環境學院、機械工程系、精密儀器系、熱能工程系、汽車工程系、電機系、自動化系、工程物理系、化工系、建設管理系、核研院、軟件學院、深圳研究生院）。
清華大學MEM重點集中清華優質教育資源，開展針對工程管理碩士的培養工作，是清華大學最早跨院系的專業學位教育中心之一。中心致力于充分發揮清華大學的工科商科優勢、產業服務平臺和國際合作資源，圍繞國家戰略需求，開展理論聯系實際的各種形式的教學活動，重在培養應用能力和職業勝任力，拓展行業視野和培養行業領導力的國家重點行業和新興產業的骨干人才。
清華MEM中心設有MEM管理委員會、培養委員會、咨詢委員會，擁有來自各相關專業院系的一百多位優秀教師，全部教師均具有博士學位和海外學習研修經歷，均為博士生導師或碩士生導師，有多年從事學術類研究生和專業類碩士研究生的授課經歷，教學經驗豐富。此外，中心還引入政府、企業和學術界的專家作為校外師資，其中前沿講座嘉賓10余人、全球移動課堂授課基地教師20余人，參與論文指導的企業聯合導師近200余人。
課程設置
公共必修課程
自然辯證法概論
英語（第一外國語）
2. 工程管理核心課程
領導與溝通
工程管理中的財務與投資
管理經濟學
工程管理中的市場與營銷
工程管理中的定量分析方法
戰略管理
工程管理前沿講座
3. 工程管理限選課程
工程管理導引
工作組織與人力資源管理
工程管理中的法律
最佳工程管理實踐
注：課程以境內或境外移動課堂的形式分次組織，學生可在導師或MEM中心指導下，自主選擇參加不少于1次有關教學活動。
4. 領域方向課程（任選一個方向）
（1）能源與環境管理方向
可持續能源發展戰略（熱能系）
太陽能及其他再生能源利用技術（熱能系）
能源環境經濟學 （核研院）
能源與資源管理學（核研院）
能源與環境評價方法學（核研院）
危險廢物管理（環境學院）
產業生態學 （環境學院）
環境與市政工程實踐與案例分析（環境學院）
注：可在導師指導下選擇其他院系或方向的相關專業基礎及專業課。
（2）設計與制造管理方向
精益運營和持續改善（工業工程系）
服務運作管理（工業工程系）
物流與供應鏈管理基礎（工業工程系）
質量與6西格瑪（工業工程系）
管理信息系統（工業工程系）
現代安全工程（工業工程系）
項目管理（工業工程系）
產品開發管理（工業工程系）
標準化導引（工業工程系）
標準化原理與方法（工業工程系）
企業標準化（工業工程系）
工程管理標準化實務（工業工程系）
注：可在導師指導下選擇其他院系或方向的相關專業基礎及專業課。
（3）信息管理方向
自動化系
領域基礎課程
系統工程與優化（自動化系）
領域專業課程
信息化戰略管理（自動化系）
工程創新與設計管理（自動化系）
現代制造與生產運作管理（自動化系）
業務流程管理與重構（自動化系）
信息化與工業化融合的系統工程（自動化系）
現代服務理論與行業應用案例（自動化系）
注：可在導師指導下選擇其他院系或方向的相關專業基礎及專業課。
軟件學院
領域基礎課程
信息管理概論（軟件學院）
業務流程與信息資產管理（軟件學院）
專業基礎及專業課
軟件工程前沿技術（軟件學院）
軟件項目管理（軟件學院）
服務系統構建與應用（軟件學院）
企業IT架構管理 （軟件學院）
云計算與新商業模式（軟件學院）
注：可在導師指導下選擇其他院系或方向的相關專業基礎及專業課。
工程管理碩士（Master of Engineering Management，簡稱MEM），旨在培養重大工程項目中既精通工程技術，又具備管理，還可將經濟、資源進行優化配置的領軍人才。MEM最早可追溯到1908年美國斯蒂文斯理工學院，80年代后在發達國家的百余所高校普及，其中不乏美國斯坦福大學、西北大學、康奈爾大學等著名院校。據統計，全美MEM畢業生的平均收入已經超過MBA畢業生，且招生人數逐年增多。
